欧亚专线S码和M码的主要区别包括尺寸限制、重量限制以及相应的运费价格，具体区别如下：

在选择运输方式时，需要根据货物的尺寸、重量和运输预算等因素进行综合考虑。具体的运费可能会受到航路、航线、季节等多种因素的影响。