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将处理好的稻草和牛粪混合在一起堆起来进行发酵，2米宽，30厘米高，18米长。每堆一层稻草就铺一层牛粪，牛粪的比例为二分之一，然后在铺稻草，一层稻草，一层牛粪，直到所有的稻草都用完。在建堆过程中浇水，原则是底层不浇水，中层少浇水，上层多浇水，一直到料堆周围有水溢出为止。
这样堆好的料一般在第四天左右温度就会升到70度左右，大约需要20～25天时间，在这段时间里要翻堆四次，第一次翻堆在建堆后5～7天，合适的水分是用手拧稻草有水溢出，第一次翻堆后5～6天进行第二次翻堆，第二次翻堆后5天左右进行第三次翻堆。
在翻堆的同时要进行施肥，施肥量为饼肥12千克、复合肥4千克、过磷酸钙10千克，第三次翻堆后四天左右进行最后一次翻堆，最后这次翻堆要把料的PH值调整到8～8之间。
蘑菇栽培料进棚后用高温水蒸汽进行二次发酵，温度58～60度，维持24小时，然后逐渐降到50度，维持48～72小时。