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制药工程专业就业方向主要从事医药产品的生产、科技开发、应用研究和经营管理等方面工作，岗位有销售工程师、设备工程师、研发工程师、销售经理等。
制药工程是一门交叉类学科，主要培养一些对医药，农药，化工和生物等方面的人才。而且现在作为一个经济发展型、环境友好型的社会，制药工程还是一个前景非常好的专业。