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工厂化养殖泥鳅选择在含腐质适中的土壤中建设养殖池，在养殖池中还要安装水处理系统，这样方便更换水质；选择抗病能力强、品质优良的泥鳅苗，泥鳅苗要大小差不多，在放苗之前要进行浸泡消毒处理；可以利用水处理系统去掉污水中的大颗粒污物、二氧化碳等有害物质，这样可以增加水体中的溶氧含量。
泥鳅的栖息环境：泥鳅为底栖鱼类，喜生活于有底淤泥的静水或缓和流水域中，如湖泊、池塘、稻田、沟渠、水库等，喜中性或偏酸性的黏性土壤，适宜的生活水温为10-32℃，最适水温为22-28℃，当水温在10℃以下或30℃以上时，泥鳅活动明显减弱，水温低于5℃或高于35℃以上时，就潜入泥中停止活动。冬季，泥鳅钻入淤泥20-30厘米处越冬，到第二年春天，水温达10℃以上时，才出来活动。